En plus des ententes spécifiques, la CRÉ peut conclure d'autres types d'ententes, dites administratives ou de partenariat. Six accords de ce genre sont actuellement en vigueur :
La CRÉ est par ailleurs partie prenante, avec deux partenaires québécois et trois autres aquitains, au protocole de coopération ayant institué les Rencontres Champlain-Montaigne en février 2000.
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